近代北港溪河道變遷
日治時期製圖水準已精進許多，具備現代科學測量基礎，從日治初期1904年的「臺灣堡圖」到中期1921年「臺灣實測地形圖」（此兩幅地圖已經幾何校正，圖幅範圍相同，圖內的十字標「+」在二幅圖內的相對位置都一樣），亦可看出原同位於笨港溪（北港溪）曲流南岸聚落的頂灣仔內、下灣仔內，因溪流不斷的侵蝕沖刷改道，經過河流截彎取直後，除明顯遺留舊河道的「牛軛湖」外，隨著頂灣仔內往東北遷移，兩地已分隔南北岸了，以致於頂灣仔內後來行政區改隸屬於雲林縣北港鎮，而下灣仔內則歸屬嘉義縣新港鄉。下灣仔內聚落跌宕的變遷，似乎沒有因此而嘎止，日後的「八七水災」、「八一水災」又再度讓它重創遷移。
出生於下灣仔內「舊厝地」的交趾陶剪黏工藝大師謝東哲受訪時表示，在灣仔內民間口傳「大水沖走灣仔內」之語，而頂灣仔內、下灣仔內、後溝、府番居民彼此也聯姻密切，他的祖母、堂姐、鄰居都是如此。僅他所知灣仔內聚落即已搬遷過二次，1905年後往東南遷至舊厝地，最後一次是八七水災隔年，1960年雪莉颱風所引發的「八一水災」效應。
1966年當時為因應北港溪防洪計畫築造堤防，下灣內共69戶438人及南港村144戶948人，配合政策遷移至河川法線外，下灣內從「舊厝地」遷移至南方「沙崙仔」（11、6鄰）、及灣仔內鐵道車站旁（13鄰），舊南港則是遷移至新港、北港間159縣道旁附近（水仙宮兩牌樓間南邊，俗稱乙地；以及日香堂至光復牛肉麵店之間，俗稱甲地），南港派出所亦受影響，由原位於水仙宮前面越上堤防右邊處，遷移至現今位置。

 

北港溪防洪堤防
北港溪跨越雲嘉兩縣市氾濫頻傳，治理河堤雖至關重大卻非常不易，日治時期整治計畫多以北岸為多， 如1930年（昭和5年）：「台南州下八掌、曾文、北港溪（扶朝家）等災害復舊工程，總經費30萬餘元」（註1）、「河川災害復舊工事，此次已得總督府認可，北港溪扶朝家等各已進行工事，大體按至三月末（1931年，昭和6 年）竣工（註2）」。1932年（昭和7 年）：「北港街西岸開始築造製水工事，1 千7 百公尺，昭和8年起連續2年實行護岸堤防工程，工程費四萬餘元（註3）」
至於北港溪南岸的新港一帶，則直到末代新巷庄長瀧野平四郎才開始著手規劃治理工程，在他的回憶錄《思い出の記- 滝野平四郎》提到：「北港溪臨北港街沿線修築了堅固的河岸而變得更加安全，但對岸新巷庄的舊南港（南港村）及崙子村落卻連年遭遇洪水被沖毀，以致居民無法安心地工作，每年都有許多人遷移外地，使得其愈顯荒涼」（註4）。
因此瀧野決定建造堅固的磚塊護岸，但因建設經費龐大，單憑新巷庄的預算不可能完成，除了尋求總督府以國庫挹注外，別無它法。他先後到台南州及總督府交涉，由總督府派出技術官員與內務局長現場視察，最終決定崙子與舊南港護岸工事費用，全部由國庫支應。原本補助一年經費，瀧野又設法協商延期建設，結果工期持續了三年，從1937年至1939年才完工，總共由國庫撥款15萬日圓建設經費，護岸工程完成，使新巷庄民受益良多。
1947年12月國民政府耗費24.257千（臺圓）在北港溪舊南港實施護岸工程，計護岸209.42公尺，丁壩7座（註5），1948年3月完工。1950年2月19日又在板頭厝修復堤防護岸230公尺，水壩6 座，工程費用新臺幣19萬元，同年5月31日竣工。
雖然護岸工程陸續展開， 但因北港溪治水法界線有諸多變數，以致堤防銜接處眾多，而各河段護堤工程良莠不一，洪水極易從銜接處溢入沿岸村落。而水患危害似乎有跡可尋，如時任嘉南農田水利會長的林蘭芽，在1956年的私人日記，即載有：「9月5日，黛娜颱風掠過台灣，新港受損極大，電話不通；9月13日，新港鄉長洪炳欽與埤子、板頭、南港村長等六人來訪，陳情北港溪沿岸水災遭破壞的後續處理。9月16 日，芙瑞達颱風又連袂而來，新港八個村浸泡在水中，一位鄭姓警員殉職；9月19日，到北港參加北港溪護岸修復；接著趕到新港埤子村看東石支線受損情形。隔天，趕到中庄、溪南視察；11月12日，板頭厝許牛之子許連川與劉某又為北港溪堤防改修之事而來。（註6）隨後旋即於1957 年7月12 日動員大批人力修築埤子頭堤防，至同年7月30日完工。
此外，沿岸居民為方便至堤防內河灘地、農田耕種，偶會有挖掘越堤開口以利人獸通行小徑，在眾人不查洪水來臨之時易成破口，加劇災情擴大。同時日治時期計畫洪水量為2,200m³/秒，以及過去最高紀錄洪水流量2,748m³/ 秒，要抵禦八七水災3,451 m³/ 秒的洪水量，無異是難上加難。

註1：〈臺南州の護岸災害復舊水害からが免がれ地方民大喜び〉，《臺灣日日新報》，1930年4月27 日，第10786 號，版5。
註2：〈臺南州豫定計畫　風水害復舊工事　大體於三月竣工〉，《臺灣日日新報》，1931年1月21日，第11053 號，版04。
註3：〈北港／護岸堤防臺南州北港郡北港街〉，《漢文版臺灣日日新報》，1933 年1 月4 日，第11761 號，版8。
註4：《思い出の記- 滝野平四郎》，未出版，林英敏提供。瀧野平四郎，1884 ～ 1950 年，群馬縣群馬郡上郊村人，任職警察28年退休後，接替林蘭芽任新巷庄長一職，任期自1936 年（昭和11年）5月4日～ 1945年（昭和20 年）10月19 日。
註5：指由河岸向河心方向構築，藉以達到掛淤、造灘、挑流或護岸之構造物。
註6：1956 年林蘭芽私人日記未出版，陳素雲提供。